Antigua-Luberri inicia su andadura en el curso 1996/1997.
Durante los seis primeros años de ese recorrido Antigua-Luberri se estableció en el edificio del colegio de Santa Rita, a menudo en malas condiciones, a la espera de la construcción del nuevo inmueble. El traslado a la ubicación actual se produjo en el curso 2002/2003; por lo tanto, el nuevo edificio cumple ahora 19 años.
Cuando se creó el instituto Antigua-Luberri no existía en el barrio del Antiguo ni en sus cercanías oferta de enseñanza pública en el modelo D. En 1994, la publificación de las ikastolas dio lugar a un nuevo mapa escolar, y las ikastolas Jakintza, Orixe, Amassorrain e Igeldo se unieron en un nuevo proyecto: la ikastola Luberri.
Tres años después se produjo la fusión de la ikastola Luberri y el tramo de 12-16 años de la ikastola Ibai. En ese momento adquirió el nuevo instituto su denominación actual: Antigua-Luberri BHI.
En un principio, el profesorado del centro provenía de las cinco ikastolas de origen, pero a medida que aumentaba la matrícula de alumnos se unieron al proyecto profesores provenientes de otros centros. Así, en la actualidad nuestra comunidad educativa se compone de aproximadamente 100 profesores y profesoras, y 800 alumnos y alumnas.
Cuando se erigió el nuevo edificio se preveían sólo cuatro aulas por cada curso; sin embargo, a medida que ha aumentado la matriculación de alumnos el edificio se ha ido quedando pequeño. Debemos recordar, por ejemplo, que en la etapa 12-16 tenemos por cada curso seis o siete aulas. Por consiguiente, durante el curso 2017-2018 se realizaron obras de ampliación del centro, y las nuevas aulas se utilizaron por primera vez durante el curso 2018-2019.
Antigua-Luberri BHI es un centro de titularidad pública (Departamento de Educación del Gobierno Vasco).